印尼国立巴查查兰大学最初是由印尼西爪哇一些有成就的社会人士创立的。他们的初衷是希望建立一个能将当地青年培养成未来领导人的高等学府。1957年9月11日巴查查兰大学成立。9月24日，苏加诺总统宣布，巴查查兰大学正式对外开放。在建校初期，该大学仅有四个学院。它已经拥有十五个院系和一个硕士项目，并迅速崛起为印尼高等教育的领军人物之一。在巴查查兰大学的十五个院系中，以下四个院系是在2005-2006学年才设立的：护理科学、渔业、海洋科学和农业工程。为了满足社会对药剂师的需求及适应制药科学的发展，在2006-2007学年， Unpad将原本下属数学与自然科学学院的制药系，发展成为制药学院。