科莫多国家公园世界最著名的科莫多蜥蜴保护区，四周环水、风景宜人，占地219332公顷，科莫多国家公园内主要包括科莫多岛、巴达尔岛和林恰岛，世界现存最大的蜥蜴科莫多巨蜥便是生活在这里。公园内的岛屿普遍都是悬崖峭壁，非常凶险，并且仅有很小的海湾及港口：比如普勒尤-科莫多是一个多山的岛屿，它的最高峰海拔八百二十七米，其主要部分位于热带草原气候区，有着成片的棕榈树林和广阔的草地；其一小部分地区位于覆盖着落叶林的热带气候区，有两个小的红树林生物群落点缀在落叶林中。无数的珊瑚礁同样也是公园景色的一部分：和其他印度尼西亚地区不同的是，这里的珊瑚礁受炸药捕渔业的影响损坏相对的比较小，它们组成了水下美丽的风景线。