沙丘2000剧情取自同名的科幻小说，讲述了3个庞大的家族为了争渡一种香料相互争斗，这种香料的生长的地方环境恶劣，游戏中需要派·采集车前去采集香料进行制作，消灭敌人，这种香料有着神奇的作用，每个家族的实力都不容小看，每个家族都有相互制约的武器，建造各种的建筑，各种的武器，药品，建立部队等来抵御敌人的进攻。